实验室实行“开放、联合、共建、共享”的运行机制，按照省级重点实验室规定的模式建设与管理。实验室实行主任负责制，具体负责组织建设和管理任务。运行按研究项目进行动态管理。同时参照国际著名大学的用人标准，组织国际知名学者对应聘者进行考核。将全面、坚决地贯彻“开放、流动、联合、竞争”的开放运行管理方针，充分调动资源优化、共享和利用，充分发挥学术委员会的指导、监督作用，切实加强各项日常工作的管理，努力将本科技创新平台建设成为国内相关领域的一流的科学研究和人才培养基地。

重点实验室主要机构由学术委员会、各研究方向对应的研究中心以及各服务部门组成。学术委员会由实验室聘请的国内外相关领域的知名专家组成，根据本领域学科发展的趋势，负责审议实验室技术发展和研究计划，评价项目设计试验方案，对实验室研发计划提出论证意见，供实验室研究立项提供参考；主任负责整合校内外的优势资源，面向国内外聘用贤能，并负责研究重点实验室的规划、管理等工作决策；各服务部门由服务部领导，负责实验室的日常管理，包括行政管理、对外联络、成果推广、技术平台支持等；各研究中心由研究部统一管理，对各自研究方向开展开发工作，重点实验室实行研究方向责任专家负责制，责任专家由主任负责招聘，学术委员会审定，其研究绩效由常务委员会负责考核。